一種基于Nanopore測序儀進行結核分枝桿菌耐藥檢測分析系統(tǒng)及其構建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110673816.0 申請日 -
公開（公告）號 CN113674801A 公開（公告）日 2021-11-19
申請公布號 CN113674801A 申請公布日 2021-11-19
分類號 G16B20/50（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B50/10（2019.01）I;G16B50/30（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 谷紅倉;謝長校;徐振宇;王云飛;車仙榮 申請（專利權）人 杭州圣庭醫(yī)療科技有限公司
代理機構 杭州華鼎知識產權代理事務所（普通合伙） 代理人 魏亮
地址 311113浙江省杭州市余杭區(qū)良渚街道通運街362號11幢301室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于Nanopore測序儀進行結核分枝桿菌耐藥檢測分析系統(tǒng)及其構建方法，屬于基因檢測分析領域，系統(tǒng)包括：微生物序列參考庫模塊、結核分枝桿菌耐藥參考庫模塊、病原微生物鑒定模塊、突變檢測模塊和耐藥數據庫注釋模塊；基于該系統(tǒng)的構建方法包括：構建數據比對的微生物序列參考庫，將測序數據比對到微生物序列參考庫并鑒定病原微生物，構建用于突變注釋的結核分枝桿菌耐藥參考庫，將來源于結核分枝桿菌的序列比對到結核分枝桿菌參考基因組并鑒定基因突變，將結核分枝桿菌的基因突變位點與結核分枝桿菌耐藥參考庫關聯(lián)分析突變位點的耐藥性質；本系統(tǒng)能夠快速鑒定病原微生物和檢測結核分枝桿菌耐藥性質，且靈敏度和特異性高。